Марсель Забитцер родился 17 марта 1994 года в австрийском Граце. Начал заниматься футболам в академиях "Аустрии", "ГАКа", и "Адмира Ваккер".  Играл за "Адмиру Вакер", Рапид", "Лейпциг", "Ред Булл" и "Баварию".

28-летний австриец провел 443 матча в европейских чемпионатах, включая 54 с момента своего перехода в “Баварию” в августе 2021 года. Ранее он был капитаном “Лейпцига”. На его счету 68 полных матчей за сборную Австрии. 

31 января 2023 года арендован "Манчестер Юнайтед" у "Баварии" до конца сезона 2022-23.